Genetičke studije na hipertenziju, Genetika uzrok visokog krvnog tlaka


Studije udruživanja u genomu Sažetak Hipertenzija je važan javni zdravstveni problem u svijetu. Budući da je međupoložaj ekspresije gena između genotipa i fenotipa pogodan za povezivanje genotipa s fenotipom, proveli smo studiju asocijacije genske ekspresije u dva stupnja kako bismo pronašli diferencijalno eksprimirane gene i putove za hipertenziju.

U prvoj fazi korišteno je slučajeva i kontrola kako bi se otkrili različito izraženi geni. U drugoj fazi, neovisni skup uzoraka slučajeva i kontrola korišten je za potvrđivanje rezultata. Osim toga, proveli smo analizu obogaćivanja genskog skupa GSEA u potrazi za različitim utjecajima. GSEA je identificirala ukupno 16 putova. Tri su puta povezana s interleukinom, jedan s metaboličkim sindromom, a jedan s Hedgehog signalom. Identifikacija ovih gena i putova ukazuje na važnost 1.

Uvod Hipertenzija je važan javni zdravstveni problem u svijetu.

Genetika uzrok visokog krvnog tlaka

Esencijalna hipertenzija je jedan od najnaprednijih ili povezanih čimbenika rizika za moždano krvarenje i infarkt, koronarne bolesti srca, zatajenje srca, dijabetes i bolest bubrega. Nalazi dijabetes i hipertenzija kod muškaraca genima hipertenzije mogu se koristiti ne samo za skrining visokorizičnih pojedinaca, sprečavanje razvoja bolesti, već i za rasvjetljavanje mehanizama bolesti.

Većina prethodne genetske studije o hipertenziji bila je usmjerena na hipertenziju s relativno starijom dobi. Usredotočili smo se na mladu hipertenziju koja ima jaču genetsku komponentu od hipertenzije općenito 4, 5.

U ovoj smo studiji pratili naše prethodne studije koje su koristile dobnu granicu od 50 godina kao granicu za prikazivanje hipertenzije u mladom bolesniku. Razina ekspresije gena može predstavljati fenotip koji je trenutno izravno povezan s varijacijom DNA slijeda.

genetičke studije na hipertenziju grade 2 tablete hipertenzija

Međupoložaj ekspresije gena čini ga prikladnim za premošćivanje genotipa i fenotipa 6. Nedavni napredak u molekularnoj biologiji i tehnologiji omogućio je istovremeno praćenje razina ekspresije svih gena. Provedeno je nekoliko studija povezanosti ekspresije gena na ljudsku hipertenziju 7, 8, 9, Mehanizam esencijalne hipertenzije je složen. Ciljana tkiva esencijalne hipertenzije vjerojatno su višestruka.

Ispitivanja na životinjama na ekspresiji hipertenzijskog gena koristila su tkiva aorte, srca, jetre i bubrega 11, ali ta tkiva nisu dostupna kod ljudi. Ljudske limfoblastoidne stanične linije LCL dobivaju na popularnosti kao istraživački alat za proučavanje individualnih razlika u genomu 12, LCL ima neke prednosti ne samo u svojoj privlačnosti i dostupnosti, nego iu potencijalu negiranja utjecaja na okoliš. Stanice limfoblasta se transformiraju i uzgajaju u istim uvjetima, što vjerojatno smanjuje izvore okoline varijacije 14, U ovom smo istraživanju proveli studiju udruživanja genskih izraza gena u dva stupnja.

Nakon toga, podaci hipertenzivnog miša dobiveni iz baze podataka Gene Expression Omnibus GEO 16 upotrijebljeni su za daljnju podršku naših nalaza. Štoviše, dalje smo provodili analizu obogaćivanja genskog skupa GSEA 17 kako bismo istražili jesu li transkripti obogaćeni za različite poznate puteve.

Sve metode provedene su u skladu s relevantnim etičkim smjernicama i propisima. Studirati dizajn Slika 1 prikazuje dijagram toka studije.

Studija povezanosti genske ekspresije u dva stupnja cjelovitog genoma provedena je na Han Kineskom kako bi se pronašli višestruki geni esencijalne hipertenzije s diferencijalnom ekspresijom gena kod hipertenzivnih pacijenata i normotenzivnih kontrola. Dijagram toka studije. Slika u punoj veličini U prvoj fazi uključeno je ukupno mladih bolesnika s hipertenzijom i normotenzivnih kontrola.

U drugoj fazi, još mladih pacijenata s hipertenzijom i normotenzivnih kontrola korišteno je za potvrdu nalaza u prvoj fazi. Konačno, u kombiniranoj analizi kombinirali smo slučaja i kontrolnih uzoraka. Karakteristike ovih uzoraka prikazane su u tablicama 1 i 2. Tablica pune veličine Tablica pune veličine Sudionici studije Mladi hipertenzivni bolesnici odabrani su iz "Academia Sinica Multi-Centre Genetička studija hipertenzije", koja je regrutirala ne-aboriginalne tajvanske osobe s esencijalnom hipertenzijom u dobi od 20 do 50 godina.

Detalji o ovoj genetičkoj studiji hipertenzije opisano drugdje 4, 5.

Oštar pad krvnog tlaka kod hipertenzije

Normotenzivne kontrole uzrasta i spola izabrane su iz "Han-kineske stanice i banke genoma u Tajvanu" 18 koje je osnovao Institut za biomedicinske znanosti Akademije Sinica.

Konačno, kontrole koje su odgovarale starosti i spolu odabrane su kako bi se proveli sljedeći eksperimenti. Uspostavljanje limfoblastoidnih stanica Linije limfoblastoidnih stanica LCL korištene su za profiliranje razine ekspresije gena. Ukupno 33 ml krvi je uzeto iz svakog subjekta: 17, 5 ml za osnovnu kliničku kemiju i skladištenje plazme, 5 ml za ekstrakciju DNA, 10 ml za uspostavu LCL-a i 0, 5 ml za Guthrie kartice. Louis, MO. LCL-ovi svih slučajeva i kontrola korišteni u 1. Ekstrakcija RNA i profiliranje ekspresije gena Za profiliranje ekspresije gena, par kontrolnih slučajeva analiziran je natrag prema natrag kako bi se izbjegla diferencijalna razina ekspresije uzrokovana učinkom serije.

Group, Hsinchu, Taiwan. Phalanx Human OneArray v5. Svaki uzorak je izmjeren s 3 tehnička ponavljanja 1. Za kontrolu podataka korišteni su softver za upravljanje i analizu podataka mikroprocesa, BRB Array alati 19 i R statističkog softvera.

S hipertenzijom možete piti kvas Koja su osnovna pravila liječenja povišenoga krvnog tlaka hipertenzije? Pad krvnog tlaka izaziva lučenje renina bilo koja bolest bubrega može privremeno ili trajno dovesti do hipertenzije.

Studija udruživanja ekspresije gena u dva stupnja U prvoj fazi slučajeva i kontrola korištena je logistička regresija s prilagodbom dobi, spola i BMI za identificiranje značajno diferencijalno izraženih gena sa statusom hipertenzije 0, 1 kao nezavisne varijable. Zvijezda hipertenzija balzam drugoj fazi, drugi neovisni skup uzoraka slučajeva i kontrola upotrijebljen je za potvrđivanje transkripata pronađenih u prvoj fazi.

genetičke studije na hipertenziju vazodilatatori injekcije u hipertenzije

Iste statističke metode korištene su s prilagodbom dobi, spolu i BMI. Iste metode analize korištene u prvoj i fazama korištene su u kombinacijskoj analizi.

U genetičke studije na hipertenziju stupnju, drugoj fazi i kombinacijskoj analizi za rješavanje pitanja višestruke usporedbe korištena je korekcija Bonferronija. Za izradu statističkih analiza korišten je komercijalni softver SAS 9.

Osim toga, izvršili smo i analizu osjetljivosti među pacijentima bez lijekova kako bismo potvrdili da ti transkripti nisu nastali zbog djelovanja antihipertenzivnih lijekova. Među bolesnika s hipertenzijom mladih, 55 bolesnika nisu uzimali lijekove.

BIOMEDICINSKA ISTRAŽIVANJA

Za analizu osjetljivosti koristili smo tih 55 pacijenata bez lijekova i zdravih kontrola. Sirovi intenzitet je normaliziran pomoću RMA algoritma BRB-Arraytools je korišten za analizu normaliziranih podataka s FDR je korišten za kontrolu višestrukih usporedbi. Analiza obogaćivanja skupova gena GSEA Na kraju studije povezanosti genske ekspresije u dva stupnja cjelovitog genoma, dalje smo proveli analizu obogaćivanja genskog skupa GSEA kako bismo istražili diferencijalno eksprimirane puteve.

Za provedbu analize korišteni su BRB-alati Za GSEA su uključeni svi Za dobivanje p-vrijednosti iz svakog pojedinačnog transkripta korišten je t- test s dva uzorka. Za utvrđivanje značajnih skupova gena korišteni su permutacijski test najmanjih kvadrata LS i Kolmogorov-Smirnov KS permutacijski test.

genetičke studije na hipertenziju japanski liječenje hipertenzije

Ovi rezultati su dalje validirani pomoću podataka s hipertenzivnim mišem. Analiza kvantitativnih svojstava ekspresije eQTL Integrirali smo profile ekspresije gena s podacima o SNP i broj kopija CNV kako bismo pronašli utjecajne genetske polimorfizme za diferencijalno eksprimirane gene. Upotrijebljeni su podaci iz od normotenzivnih kontrola, koji su imali podatke o genotipu i ekspresiji gena.

Šta geni otkrivaju o ponašanju - Snežana Smederevac - TEDxNoviSad

Pozivanje na genotip provedeno je korištenjem standardnog postupka koji je implementiran u BeadStudio Illumina®, Inc. Konačno, Zatim smo testirali povezanost između otkrivenih regulatornih SNP-ova ekspresije eSNP i hipertenzije s početkom u mladosti.

Nadalje, podaci o intenzitetu od genetičke studije na hipertenziju Analiza CNV-a bazirana na genima korištena je kako bi se ispitalo je li postojala značajno različita vjerojatnost CNV-a koje se siječe s danim genom između bolesnika s hipertenzijom i normotenzivnih kontrola.

Rezultati U tablicama 1 i 2 navedene su neprekidne genetičke studije na hipertenziju kategorijske karakteristike, odnosno, slučajeva hipertenzije mladih i normotenzivne kontrole.